Yeni araştırma, insanları Kovid-19’a karşı doğal olarak koruyan genetik faktörlerin anlaşılmasına katkıda bulunuyor

HadessTruck

Global Mod
Global Mod
WASHINGTON: Brezilyalı araştırmacıların yakın tarihli iki makalesi, insanları SARS-CoV-2 enfeksiyonundan koruyan veya şiddetli Covid-19’a ilerlemesini önleyen genetik faktörlerin bilimsel olarak anlaşılmasına katkıda bulundu. İlki, 90 yaş ve üstü bir grup dirençli yaşlı insan üzerinde yapılan bir araştırmanın bulgularını açıklarken, ikincisi, yalnızca birinin uzun süreli hastalık semptomları gösterdiği tek yumurta ikizlerinde görülen şiddetli bir covid-19 vakasını inceliyor.
2020’den bu yana Brezilya da dahil olmak üzere birçok ülkedeki araştırmacılar, bu bilginin aşı geliştirmeye önemli bir katkı sağlayacağını umarak ya enfeksiyonu önleyerek ya da ciddi hastalığa ilerlemeyi önleyerek yeni koronavirüse karşı koruma sağlayan genler arıyorlar. ve viral hastalıklar için tedaviler.
“Bazı genlerin SARS-CoV-2’ye karşı direnci desteklediğini gerçekten kanıtlayabilirsek, aynısı diğer virüsler için de geçerli olabilir. Bu bulgulara dayanarak, bu dayanıklılığın altında yatan mekanizmaları anlamaya çalışmak ve viral enfeksiyonlara karşı korumayı artıran ilaçlar geliştirmek için daha fazla araştırma yapılabilir.” Maya Zatzve “Frontiers in” dergilerinde yayınlanan makalelerin baş yazarı, Agencia FAPESP’ye söyledi.
Zatz, Sao Paulo Üniversitesi Biyolojik Bilimler Enstitüsü’nde (IB-USP) insan ve tıbbi genetik profesörüdür ve İnsan genomu ve kök hücre araştırma merkezi (HUG-CELL), FAPESP’nin Araştırma, Yenilik ve Yaygınlaştırma Merkezlerinden (RIDC’ler) biridir.
Çalışmalardan birinde, bilim adamları SARS-CoV-2’ye direnç kazandıran genleri belirlemeye ve iki uçta yer alan mekanizmaları anlamaya çalıştılar: yandaş hastalıkları olsa bile hastalığa dirençli olan yaşlılar; ve çok şiddetli Covid-19 geliştiren ve hatta bazı durumlarda ölen, komorbiditesi olmayan daha genç insanlar.
Bir çalışmada araştırmacılar, hafif Covid-19’dan iyileşen veya SARS-CoV-2 için pozitif test ettikten sonra asemptomatik kalan 90 yaşın üzerindeki 87 “dayanıklı süper yaşlı” kohort için veri setlerini analiz ettiler. Ortalama yaşları 94’tü. Çalışma sırasında bir kadın 114 yaşındaydı ve Brezilya’da hastalıktan iyileşen en yaşlı hasta olarak kabul ediliyordu.
Bu hastalardan alınan verileri, ağır Covid-19’dan iyileşen veya ölen 60 yaşın altındaki 55 hastanın verileriyle ve Sao Paulo şehrinin yaşlı sakinlerinden alınan tam genom dizilerinden oluşan bir veritabanıyla karşılaştırdılar.
Spesifik olarak, doğuştan gelen ve kazanılmış bağışıklık tepkilerinde yer alan moleküllerin birçoğunu kodlayan yaklaşık 130 gen içeren DNA’nın polimorfik bir parçası olan, ana histo-uyumluluk kompleksi (MHC) olarak bilinen bir kromozom 6 bölgesini analiz ettiler. Bu analiz özel ekipman ve araçlar gerektiriyordu.
Ayrıca, dahil olan genomların protein kodlayan kısmını yansıtan ekzomu (tüm eksonların dizisi) analiz ettiler.
SARS-CoV-2 enfeksiyonu, toplu Covid-19 aşılamasının başlamasından önce, 2020’nin başlarında toplanan numunelerin RT-PCR testiyle doğrulandı.
Üç çok önemli sonuca ulaştılar, bunlardan ikisi ancak etnik köken ve köken açısından çok karışık bir popülasyondan alınan örnekler kullanılarak mümkün oldu.
Birincisi, MUC22 geninin varyantlarının sıklığının hafif Kovid-19 grubunda ağır hastalara göre iki kat, hatta dirençli süper yaşlılarda daha yüksek olmasıydı. Bu gen müsin ailesine aittir ve hava yollarını kayganlaştıran ve koruyan mukus üretimi ile ilişkilidir. Öte yandan, aşırı mukus üretimi, şiddetli Covid-19’u karakterize eden pnömoni ile ilişkilendirilmiştir.
MUC22’deki bu mutasyonlara teknik olarak “yanlış anlamlı” varyantlar denir, sonuçta ortaya çıkan proteinlerde belirli konumlarda farklı amino asitlerin kodlanmasına yol açan DNA değişiklikleri. Makaleye göre SARS-CoV-2’ye karşı hiperaktif bağışıklık tepkilerini zayıflatabiliyorlar ve solunum yollarının virüse karşı korunmasında önemli rol oynuyorlar. Bu nedenle yazarların hipotezlerinden biri, dayanıklı deneklerin müsin üretimi üzerinde optimal kontrole sahip olduğudur.
“Misafir varyantlar sadece mukus üretimini bozmakla kalmıyor, aynı zamanda amino asitler yer değiştirdiği için bileşimini de bozuyor olabilir. Enfeksiyonlar sırasında ve sağlıklı insanlarda nasıl çalıştıklarını anlamak için daha fazla çalışma yapmamız gerekiyor” dedi. Eric CastelliBotucatu’daki Sao Paulo Eyalet Üniversitesi Tıp Okulu’nda (FM-UNESP) bir araştırmacı ve HUG-CELL’de doktora sonrası araştırmacı olan Mateus Vidigal ile birlikte makalenin ilk yazarı.
Makale Frontiers in Immunology’de yayınlandı. Çalışma FAPESP tarafından HUG-CELL, Ulusal Yaşlanma ve Genetik Bozukluklar Bilim ve Teknoloji Enstitüsü ve diğer dört proje (19/19998-8, 20/09702-1, 13/17084-2 ve 17/19223) aracılığıyla desteklenmiştir. – 0).
Araştırılması gereken başka bir nokta, MUC22 varyantları ile miR-6891 adı verilen bir mikroRNA’nın artan ifadesi arasındaki bağlantıdır. Genetik veritabanı araştırması, bu mikroRNA’nın viral genom ile ilişkili olduğunu göstermiştir. Yazarlar, tüm MUC22 koruyucu varyantlarıyla ilişkili daha yüksek miR-6891-5p ekspresyonunun hücrelerde viral üremeyi bir şekilde azaltabileceğini ve SARS-CoV-2 enfeksiyonu sırasında daha az şiddetli semptomlara katkıda bulunabileceğini varsayıyorlar.
Birikmiş bilgi
Çalışmanın diğer iki önemli sonucu, Afrikalılar ve Güney Amerikalılarda en yaygın olan gen varyantlarıyla ilgilidir. Biri, HLA-DOB geninin *01:02 alelidir. Hesaplamalı analiz, HLA-DOB’nin proteinin hücresel lokalizasyonunu ve taşınmasını etkileyebileceğini ve potansiyel olarak yetersiz antijen sunumuna yol açabileceğini öne sürdü – makrofajların ve diğer hücre türlerinin antijeni yakalayarak sitotoksik T hücreleri tarafından tanınmasına izin verdiği süreç. yabancı bir cisme tepki. Araştırmacılar, hücrenin içinden yüzeye protein hareketinin değiştirilebileceği ve enfeksiyonu şiddetlendirebileceği sonucuna vardılar. Bu genin sıklığı, şiddetli vakalarda hafif Covid-19 vakalarına göre üç kat daha yüksekti.
Castelli, “Bu HLA-DOB varyantı, çalışmamızda ikinci kez tespit ediliyor. Evli çiftler çalışmamızda, enfekte olmayan deneklere kıyasla COVID-19 vakalarıyla ilişkili olduğunu bulduk” dedi. “Bu sefer ciddi vakalarda bulduk. Numunelerimizin Afrika ve Güney Amerika atalarından kalma bileşenlerle karışık bileşimi nedeniyle yerini tespit edebildik. Bu alandaki araştırmaların çoğu Avrupa’da yapıldı ve olası değiller. yapacak.” orada bul.”
Castelli, kendisinin, Zatz ve Vidigal’in de üyesi olduğu bir grup tarafından 2021’de yayınlanan ve neden bazı insanların SARS-CoV-2 enfeksiyonuna karşı doğal olarak dayanıklı olduğunu, diğerlerinin ise olmadığını anlamak için ilk adımları atan bir araştırmaya atıfta bulundu. Araştırmacılar, her ikisi de virüse maruz kalmış olmasına rağmen, yalnızca karı veya kocanın enfekte olduğu anlamında uyumsuz olarak adlandırılan 86 çiftin genetik materyalini analiz ettiler.
Sonuçlar, dayanıklı deneklerde daha yaygın olan belirli genetik varyantların, doğal öldürücüler (NK’ler) olarak bilinen bağışıklık hücrelerinin daha verimli aktivasyonu ile ilişkili olduğunu ileri sürdü. Uygun şekilde etkinleştirildiğinde, NK’ler enfekte olmuş hücreleri tanıyabilir ve yok edebilir, hastalığın organizmada gelişmesini engeller (daha fazla bilgi için: agencia.fapesp.br/35839).
Örnek toplamada etkili olan Vidigal’e göre, grubun kendisi önemli. “Süper yaşlılara odaklanarak hem vakalar – hafif, şiddetli ve ölümcül – hem de yaş açısından aşırılıkları analiz ettik. Bu hastaları izlemeye devam ediyoruz ve asırlıklarla yeni projeler geliştiriyoruz” dedi.
Üçüncü önemli sonuç, hücre yüzeyinde hangi proteinlerin hücre içinde olduğunu bağışıklık hücrelerine göstermek için hücre yüzeyinde bir “pencere” oluşturmaktan sorumlu genlerden biri olan HLA-A ile ilgiliydi. Bu genin bir varyantı, şiddetli Covid-19 hastalarında iki kat daha yaygındı.
Covid sonrası
Diğer çalışmada bilim adamları, aynı anda şiddetli Covid-19 gösteren, o zamanlar 32 yaşında olan tek yumurta ikizlerinden oluşan bir vakayı analiz ettiler. Yaşlarına ve sağlık durumlarının iyi olmasına rağmen hastaneye kaldırıldılar ve oksijen desteği verildi. Tesadüfen hemen yoğun bakıma alındılar ve aynı gün entübe edildiler. Ancak kardeşlerden biri bir hafta daha hastanede kaldı ve sadece bu ikizler uzun süre Covid geçirdi, bulaştıktan yedi ay sonra bile yorgunluk ve diğer semptomlardan muzdarip olmaya devam etti.
Araştırmacılar, ikizlerin bağışıklık hücresi profillerini ve virüse spesifik tepkilerini analiz ettikten ve ekzomlarını belirledikten sonra, farklı klinik ilerlemelerinin, hastalığın ortaya çıkışı ve seyrinde hem bağışıklık tepkisinin hem de genetiğin rolünü güçlendirdiği sonucuna vardılar.
Frontiers in Medicine’de yayınlanan çalışmayla ilgili bir makalede, ağır Covid-19 geliştirme riskinin artmasıyla ilişkili olabilecek aynı genetik mutasyonları paylaşmalarına rağmen kardeşlerin klinik ilerlemesinin farklı olduğuna ve Kovid sonrası sendromun ortaya çıktığına dikkat çekiyorlar. bunlardan birinde gözlemlenen, hastaneye yatış ile uzun süreli covid semptomlarının ortaya çıkması arasında bir ilişki olduğunu gösterdi.
“Brezilya’da, hastalığın genetik bileşenine dikkat çekerek yedi çift yetişkin tek yumurta ikizinin hastalıktan öldüğü vakalar zaten rapor edilmişti. Aynı anda ağır Covid-19 geçiren bu ikiz kardeşleri duyunca ve gerçeği ancak hastanede öğrenince araştırmak istedik. Makalenin baş yazarı Vidigal, “Aynı anda enfekte olmaları ve hastalığın şiddetli formunu geliştirmeleri, genetik faktör hipotezini güçlendirdi” dedi. Bu çalışma, FAPESP tarafından da desteklendi.
Covid sonrası yorgunlukla ilişkili değişen sistemik parametreler arasında ferritin (karaciğer tarafından üretilen ve vücudun demir metabolizmasında yer alan bir protein) ve kreatin kinaz (kalp, beyin ve iskelet kaslarında bulunan bir enzim) yer alıyor.
Zatz, “Bunun gibi çalışmalarda genomik, immünoloji ve klinik değerlendirmeyi içerdiğinden ekip çalışması son derece önemlidir” dedi. “Karmaşık soruları yanıtlamak istiyorsanız, deneyi nasıl kuracağınızı bilmeniz ve yanıtları bulmanıza en iyi yardımcı olabilecek hastaları belirlemeniz gerekir ve bu kolay değil.”
Zorluk o kadar büyük ki, uluslararası bir araştırma ekibi geçen Ekim ayında Nature’da SARS-CoV-2’ye genetik olarak dirençli insanlar için bir çağrı yayınladı.